WEKO3
アイテム
メダカゲノム情報によるステロール生合成遺伝子の解析～メダカSqualene epoxidase の遺伝子構造～
http://hdl.handle.net/10780/1460
http://hdl.handle.net/10780/14609c6e4625-4df3-4246-a005-342c05ebbf08
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
|---|---|---|
3005-Nishino-Tanaka-2013.pdf (4.9 MB)
|
|
| Item type | 紀要論文 / Departmental Bulletin Paper(1) | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| 公開日 | 2013-04-15 | |||||
| タイトル | ||||||
| タイトル | メダカゲノム情報によるステロール生合成遺伝子の解析～メダカSqualene epoxidase の遺伝子構造～ | |||||
| 言語 | ja | |||||
| タイトル | ||||||
| タイトル | メダカ ゲノム ジョウホウ ニヨル ステロール セイゴウセイ イデンシ ノ カイセキ メダカ Squalene epoxidase ノ イデンシ コウゾウ | |||||
| 言語 | ja-Kana | |||||
| タイトル | ||||||
| タイトル | Analysis of sterol biosynthesis genes from the genome information of Medaka Oryzias latipes The estimation of gene structure of Squalene epoxidase | |||||
| 言語 | en | |||||
| 言語 | ||||||
| 言語 | jpn | |||||
| キーワード | ||||||
| 主題Scheme | Other | |||||
| 主題 | ETYP:教育関連論文 | |||||
| 資源タイプ | ||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 | |||||
| 資源タイプ | departmental bulletin paper | |||||
| アクセス権 | ||||||
| アクセス権 | open access | |||||
| アクセス権URI | http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 | |||||
| 著者 |
西野, 秀昭
× 西野, 秀昭× 田中, 哲 |
|||||
| 抄録 | ||||||
| 内容記述タイプ | Abstract | |||||
| 内容記述 | The gene structure of Medaka Oryzias latipes Squalene epoxidase was investigated through BLAST search by comparison of National BioResource Project, Medaka genome database, with the cDNA base sequences of Homo sapiens and Danio rerio in order to elucidate the mechanism of biological evolution of sterol biosynthesis genes. As the results, the all possible exon structure, 1st exon to 11th exon consisting of 1716 bp open reading frame and the estimated 572 amino acid residues, of Squalene epoxidase of Medaka Oryzias latipes were extracted as the strong candidates in the 16th chromosome data base. The deleted parts of the 1st and 2nd exons in Danio rerio Squalene epoxidase were also found in comparison to the enzyme of Homo sapiens and Oryzias latipes. ステロール生合成遺伝子が，生物進化の過程で如何にして創生されてきたか探究するため，ステロール生合成経路の調節段階でもある酵素をコードするSqualene epoxidase 遺伝子の構造を複数の生物で比較する目的で，メダカOryzias latipes のSqualene epoxidase 遺伝子構造の解明に取り組んだ。ヒトHomo sapiens やゼブラフィッシュDanio rerio のSqualene epoxidase のcDNA 構造でナショナルバイオリソースプロジェクト・メダカゲノムデータベースを対象にBLAST 検索を行った。その結果，第16 番染色体をBLAST 検索の対象とすると，メダカOryzias latipes のSqualene epoxidase の第1 から第11exon の候補全てを見出すことができた。読み枠の塩基対の数は終止コドンを除き1716，推定アミノ酸配列の残基数は572 個であった。11 個というexon 数はHomo sapiens, Danio rerio と同じであった。一方，第2exon で，Homo sapiensやOryzias latipes と比較してDanio rerio では欠失していると考えられる塩基配列が見いだされた。推定アミノ酸配列も第1exon と第2exon 以外は高度に類似していた。これらのことから，メダカゲノムデータベースから得られた塩基配列は，メダカSqualene epoxidase 遺伝子であると考えられた。 |
|||||
| 書誌情報 |
福岡教育大学紀要. 第三分冊, 数学・理科・技術科編 Bulletin of Fukuoka University of Education. Part III, Mathematics, natural sciences and technology 巻 62, p. 49-60, 発行日 2013-02-08 |
|||||
| ISSN | ||||||
| 収録物識別子タイプ | PISSN | |||||
| 収録物識別子 | 0532-811X | |||||
| 出版者 | ||||||
| 出版者 | 福岡教育大学 | |||||
