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アイテム
メダカゲノム情報によるステロール生合成遺伝子の解析 ～メダカDHCR7 遺伝子全構造の推定～
http://hdl.handle.net/10780/1588
http://hdl.handle.net/10780/1588497ef5d1-bbd6-4142-b4b3-0bdc774ac57a
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
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3007-Nishino-2014.pdf (3.5 MB)
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| Item type | 紀要論文 / Departmental Bulletin Paper(1) | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| 公開日 | 2014-05-26 | |||||
| タイトル | ||||||
| タイトル | メダカゲノム情報によるステロール生合成遺伝子の解析 ～メダカDHCR7 遺伝子全構造の推定～ | |||||
| 言語 | ja | |||||
| タイトル | ||||||
| タイトル | メダカゲノム ジョウホウ ニ ヨル ステロール セイゴウセイ イデンシ ノ カイセキ ～ メダカDHCR7 イデンシ ゼンコウゾウ ノ スイテイ ～ | |||||
| 言語 | ja-Kana | |||||
| タイトル | ||||||
| タイトル | Analysis of sterol biosynthesis genes from the genome information of Medaka Oryzias latipes The estimation of complete gene structure of DHCR7 | |||||
| 言語 | en | |||||
| 言語 | ||||||
| 言語 | jpn | |||||
| キーワード | ||||||
| 主題Scheme | Other | |||||
| 主題 | ETYP:教育関連論文 | |||||
| 資源タイプ | ||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 | |||||
| 資源タイプ | departmental bulletin paper | |||||
| アクセス権 | ||||||
| アクセス権 | open access | |||||
| アクセス権URI | http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 | |||||
| 著者 |
西野, 秀昭
× 西野, 秀昭× 甲斐, 愼 |
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| 抄録 | ||||||
| 内容記述タイプ | Abstract | |||||
| 内容記述 | The possible complete gene structure of Medaka Oryzias latipes DHCR7, in which the enzyme sterol Δ7-reductase is encoded, was investigated through BLAST search by comparison of National BioResource Project, Medaka genome database, with the cDNA base sequences of Homo sapiens and Danio rerio in order to elucidate the mechanism of biological evolution of sterol biosynthesis genes. As the results, all possible exon structures, 1st exon to 7th exon consisting of 1419 bp open reading frame containing stop codon and the estimated 472 amino acid residues, of DHCR7 of Medaka Oryzias latipes were extracted as the strong candidate in the Medaka third chromosome database. The estimated primary structures of the all exons except first exon were very similar between Medaka Oryzias latipes, Danio rerio, and Homo sapiens. The Medaka DHCR7 also contains S-1 sequence, which is a unique motif in the primary structure of sterol Δ7-reductase. \nステロール生合成遺伝子が，生物進化の過程で創生されてきた機構を探究するため，ステロール生合成経 路の酵素sterol Δ7-reductase をコードする遺伝子DHCR7 の構造を複数の生物で比較する目的で，メダカ Oryzias latipes のDHCR7 構造の全解明に取り組んだ。既に推定されているDHCR7 のexon2 と3 の候補配 列でNational BioResource Project Medaka Genome Database を対象にBLAST 検索を行った。その結果， 第3 染色体で，メダカOryzias latipes のDHCR7 の第1 から第7 exon の候補全てを見出すことができた。 開始コドンから終止コドンまでの読み枠の塩基対数は1419 個，推定アミノ酸残基数は472 個であった。7 個というexon 数は，ヒトHomo sapiens やゼブラフィッシュDanio rerio と同じであった。推定アミノ酸配 列も第1 exon 以外は三者で高度に類似し，sterol Δ7-reductase のコンセンサス配列S-1 も有していた。こ れらから，Medaka Genome Database 第3 染色体から得られた塩基配列は，メダカDHCR7 遺伝子である と考えられた。 |
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| 書誌情報 |
福岡教育大学紀要. 第三分冊, 数学・理科・技術科編 Bulletin of Fukuoka University of Education. Part III, Mathematics, natural sciences and technology 巻 63, p. 81-89, 発行日 2014-02-10 |
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| ISSN | ||||||
| 収録物識別子タイプ | PISSN | |||||
| 収録物識別子 | 0532-811X | |||||
| 出版者 | ||||||
| 出版者 | 福岡教育大学 | |||||
